Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC38A11Q08AI6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A11Q08AI6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A11Q08AI6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC38A11Q08AI6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms