Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM1Q08AH1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSM1Q08AH1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSM1Q08AH1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM1Q08AH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM1Q08AH1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms