Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD300CQ08708 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD300CQ08708 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD300CQ08708 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD300CQ08708 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms