Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TGM3Q08188 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM3Q08188 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM3Q08188 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM3Q08188 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms