Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms