Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KDSRQ06136 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDSRQ06136 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDSRQ06136 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDSRQ06136 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms