Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB3Q05901 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB3Q05901 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNB3Q05901 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB3Q05901 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB3Q05901 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms