Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARDQ03181 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARDQ03181 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARDQ03181 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARDQ03181 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARDQ03181 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms