Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ID3Q02535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ID3Q02535 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ID3Q02535 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ID3Q02535 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ID3Q02535 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ID3Q02535 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ID3Q02535 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ID3Q02535 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ID3Q02535 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ID3Q02535 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ID3Q02535 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ID3Q02535 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ID3Q02535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ID3Q02535 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ID3Q02535 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ID3Q02535 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ID3Q02535 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ID3Q02535 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ID3Q02535 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ID3Q02535 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ID3Q02535 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ID3Q02535 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ID3Q02535 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ID3Q02535 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ID3Q02535 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ID3Q02535 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ID3Q02535 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ID3Q02535 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ID3Q02535 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ID3Q02535 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ID3Q02535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ID3Q02535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ID3Q02535 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms