Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUCB2P80303 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUCB2P80303 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUCB2P80303 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NUCB2P80303 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUCB2P80303 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUCB2P80303 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms