Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX5P78411 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX5P78411 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX5P78411 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX5P78411 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX5P78411 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX5P78411 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX5P78411 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX5P78411 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX5P78411 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX5P78411 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX5P78411 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX5P78411 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX5P78411 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IRX5P78411 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IRX5P78411 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX5P78411 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX5P78411 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX5P78411 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX5P78411 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX5P78411 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX5P78411 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX5P78411 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX5P78411 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX5P78411 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX5P78411 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX5P78411 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX5P78411 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX5P78411 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX5P78411 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX5P78411 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX5P78411 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX5P78411 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX5P78411 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX5P78411 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX5P78411 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX5P78411 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX5P78411 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX5P78411 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX5P78411 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX5P78411 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX5P78411 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX5P78411 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX5P78411 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX5P78411 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX5P78411 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX5P78411 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX5P78411 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX5P78411 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX5P78411 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX5P78411 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX5P78411 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX5P78411 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
IRX5P78411 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX5P78411 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX5P78411 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX5P78411 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX5P78411 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX5P78411 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX5P78411 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX5P78411 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX5P78411 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX5P78411 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX5P78411 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX5P78411 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX5P78411 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX5P78411 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX5P78411 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX5P78411 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX5P78411 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX5P78411 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX5P78411 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX5P78411 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX5P78411 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX5P78411 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX5P78411 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX5P78411 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX5P78411 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms