Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT83P78385 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT83P78385 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT83P78385 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT83P78385 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT83P78385 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT83P78385 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT83P78385 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT83P78385 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT83P78385 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT83P78385 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT83P78385 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT83P78385 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT83P78385 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT83P78385 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT83P78385 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT83P78385 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT83P78385 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT83P78385 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT83P78385 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT83P78385 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT83P78385 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT83P78385 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT83P78385 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT83P78385 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT83P78385 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT83P78385 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT83P78385 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT83P78385 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT83P78385 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT83P78385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT83P78385 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT83P78385 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT83P78385 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT83P78385 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT83P78385 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT83P78385 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT83P78385 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT83P78385 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT83P78385 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT83P78385 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT83P78385 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT83P78385 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT83P78385 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT83P78385 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT83P78385 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT83P78385 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT83P78385 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT83P78385 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT83P78385 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT83P78385 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT83P78385 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT83P78385 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT83P78385 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT83P78385 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT83P78385 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT83P78385 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT83P78385 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT83P78385 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT83P78385 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT83P78385 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT83P78385 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT83P78385 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT83P78385 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT83P78385 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT83P78385 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT83P78385 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT83P78385 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT83P78385 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT83P78385 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT83P78385 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT83P78385 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms