Protein–RNA interactions for Protein: P62312

LSM6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM6P62312 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM6P62312 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM6P62312 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM6P62312 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM6P62312 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM6P62312 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM6P62312 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM6P62312 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM6P62312 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM6P62312 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM6P62312 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM6P62312 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM6P62312 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM6P62312 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM6P62312 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM6P62312 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM6P62312 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM6P62312 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM6P62312 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM6P62312 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM6P62312 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM6P62312 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM6P62312 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM6P62312 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM6P62312 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM6P62312 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM6P62312 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM6P62312 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM6P62312 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM6P62312 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM6P62312 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM6P62312 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM6P62312 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM6P62312 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM6P62312 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM6P62312 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM6P62312 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM6P62312 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM6P62312 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM6P62312 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM6P62312 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM6P62312 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM6P62312 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM6P62312 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM6P62312 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM6P62312 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM6P62312 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM6P62312 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM6P62312 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM6P62312 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM6P62312 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM6P62312 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM6P62312 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM6P62312 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM6P62312 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM6P62312 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM6P62312 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms