Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS18P62269 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS18P62269 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS18P62269 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS18P62269 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS18P62269 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS18P62269 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS18P62269 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS18P62269 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS18P62269 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS18P62269 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS18P62269 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS18P62269 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS18P62269 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS18P62269 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS18P62269 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS18P62269 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS18P62269 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS18P62269 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS18P62269 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS18P62269 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS18P62269 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS18P62269 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS18P62269 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS18P62269 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS18P62269 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS18P62269 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS18P62269 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS18P62269 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS18P62269 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS18P62269 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS18P62269 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS18P62269 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS18P62269 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS18P62269 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS18P62269 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS18P62269 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS18P62269 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS18P62269 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS18P62269 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS18P62269 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS18P62269 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS18P62269 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS18P62269 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS18P62269 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS18P62269 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS18P62269 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS18P62269 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS18P62269 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS18P62269 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS18P62269 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS18P62269 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS18P62269 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS18P62269 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS18P62269 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS18P62269 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS18P62269 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS18P62269 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS18P62269 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPS18P62269 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS18P62269 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms