Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P61574 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P61574 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERVK_113P61574 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113P61574 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms