Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFA3P59666 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DEFA3P59666 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DEFA3P59666 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DEFA3P59666 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEFA3P59666 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms