Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX16P57768 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX16P57768 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX16P57768 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX16P57768 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX16P57768 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX16P57768 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX16P57768 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX16P57768 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX16P57768 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX16P57768 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX16P57768 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX16P57768 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX16P57768 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX16P57768 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX16P57768 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX16P57768 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX16P57768 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX16P57768 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX16P57768 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX16P57768 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX16P57768 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX16P57768 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX16P57768 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX16P57768 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX16P57768 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX16P57768 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX16P57768 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX16P57768 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX16P57768 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX16P57768 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX16P57768 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX16P57768 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX16P57768 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX16P57768 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX16P57768 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX16P57768 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX16P57768 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX16P57768 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX16P57768 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX16P57768 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX16P57768 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX16P57768 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX16P57768 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX16P57768 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX16P57768 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX16P57768 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX16P57768 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX16P57768 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX16P57768 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX16P57768 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX16P57768 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX16P57768 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX16P57768 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX16P57768 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX16P57768 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX16P57768 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX16P57768 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX16P57768 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX16P57768 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX16P57768 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX16P57768 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX16P57768 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX16P57768 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX16P57768 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX16P57768 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms