Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RP1P56715 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RP1P56715 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RP1P56715 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP1P56715 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RP1P56715 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1P56715 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1P56715 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1P56715 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1P56715 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RP1P56715 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP1P56715 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP1P56715 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RP1P56715 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1P56715 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1P56715 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1P56715 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RP1P56715 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1P56715 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1P56715 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RP1P56715 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RP1P56715 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP1P56715 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RP1P56715 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RP1P56715 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP1P56715 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RP1P56715 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RP1P56715 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RP1P56715 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RP1P56715 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1P56715 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1P56715 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1P56715 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1P56715 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RP1P56715 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP1P56715 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP1P56715 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP1P56715 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RP1P56715 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1P56715 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1P56715 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1P56715 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1P56715 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RP1P56715 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP1P56715 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RP1P56715 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RP1P56715 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RP1P56715 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RP1P56715 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RP1P56715 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP1P56715 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP1P56715 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP1P56715 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RP1P56715 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RP1P56715 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1P56715 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1P56715 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1P56715 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1P56715 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RP1P56715 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1P56715 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1P56715 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1P56715 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1P56715 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RP1P56715 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RP1P56715 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RP1P56715 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RP1P56715 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1P56715 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1P56715 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1P56715 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RP1P56715 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1P56715 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1P56715 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1P56715 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1P56715 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RP1P56715 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RP1P56715 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP1P56715 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RP1P56715 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms