Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTBP2P56545 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTBP2P56545 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTBP2P56545 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms