Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
RRP1P56182 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP1P56182 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RRP1P56182 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP1P56182 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP1P56182 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RRP1P56182 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP1P56182 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP1P56182 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP1P56182 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP1P56182 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP1P56182 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP1P56182 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP1P56182 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP1P56182 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP1P56182 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP1P56182 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRP1P56182 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRP1P56182 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP1P56182 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP1P56182 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP1P56182 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP1P56182 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP1P56182 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP1P56182 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP1P56182 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP1P56182 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP1P56182 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP1P56182 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP1P56182 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP1P56182 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP1P56182 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP1P56182 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP1P56182 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP1P56182 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP1P56182 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP1P56182 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP1P56182 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP1P56182 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP1P56182 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRP1P56182 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRP1P56182 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRP1P56182 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RRP1P56182 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RRP1P56182 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRP1P56182 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RRP1P56182 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRP1P56182 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RRP1P56182 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRP1P56182 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RRP1P56182 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RRP1P56182 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP1P56182 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP1P56182 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP1P56182 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP1P56182 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RRP1P56182 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRP1P56182 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRP1P56182 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RRP1P56182 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRP1P56182 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRP1P56182 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RRP1P56182 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RRP1P56182 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRP1P56182 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RRP1P56182 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RRP1P56182 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RRP1P56182 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RRP1P56182 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
RRP1P56182 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP1P56182 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP1P56182 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP1P56182 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP1P56182 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP1P56182 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP1P56182 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP1P56182 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP1P56182 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP1P56182 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP1P56182 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP1P56182 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP1P56182 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRP1P56182 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRP1P56182 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP1P56182 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP1P56182 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP1P56182 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP1P56182 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP1P56182 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP1P56182 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms