Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH12P55289 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH12P55289 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH12P55289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH12P55289 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH12P55289 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH12P55289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH12P55289 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH12P55289 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH12P55289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH12P55289 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH12P55289 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH12P55289 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH12P55289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH12P55289 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH12P55289 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH12P55289 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH12P55289 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH12P55289 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH12P55289 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH12P55289 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH12P55289 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH12P55289 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH12P55289 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH12P55289 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH12P55289 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH12P55289 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH12P55289 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH12P55289 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH12P55289 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH12P55289 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH12P55289 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH12P55289 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH12P55289 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH12P55289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH12P55289 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH12P55289 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH12P55289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH12P55289 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH12P55289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH12P55289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH12P55289 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH12P55289 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH12P55289 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH12P55289 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH12P55289 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH12P55289 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH12P55289 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH12P55289 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH12P55289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH12P55289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH12P55289 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH12P55289 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH12P55289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH12P55289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH12P55289 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms