Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1BP51168 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1BP51168 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1BP51168 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCNN1BP51168 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCNN1BP51168 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCNN1BP51168 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCNN1BP51168 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms