Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSK3BP49841 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSK3BP49841 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSK3BP49841 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3BP49841 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GSK3BP49841 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms