Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUMBP49757 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUMBP49757 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUMBP49757 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUMBP49757 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUMBP49757 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUMBP49757 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUMBP49757 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUMBP49757 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUMBP49757 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUMBP49757 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUMBP49757 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUMBP49757 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUMBP49757 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUMBP49757 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUMBP49757 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NUMBP49757 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUMBP49757 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUMBP49757 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUMBP49757 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUMBP49757 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUMBP49757 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUMBP49757 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUMBP49757 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUMBP49757 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUMBP49757 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUMBP49757 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUMBP49757 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUMBP49757 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUMBP49757 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUMBP49757 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NUMBP49757 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUMBP49757 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUMBP49757 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUMBP49757 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUMBP49757 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUMBP49757 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUMBP49757 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUMBP49757 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUMBP49757 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUMBP49757 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUMBP49757 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUMBP49757 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUMBP49757 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUMBP49757 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUMBP49757 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUMBP49757 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUMBP49757 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUMBP49757 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUMBP49757 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUMBP49757 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUMBP49757 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUMBP49757 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUMBP49757 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUMBP49757 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUMBP49757 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUMBP49757 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUMBP49757 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUMBP49757 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUMBP49757 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUMBP49757 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUMBP49757 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUMBP49757 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUMBP49757 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUMBP49757 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUMBP49757 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUMBP49757 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUMBP49757 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUMBP49757 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUMBP49757 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUMBP49757 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUMBP49757 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUMBP49757 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUMBP49757 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUMBP49757 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUMBP49757 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUMBP49757 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUMBP49757 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUMBP49757 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUMBP49757 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUMBP49757 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUMBP49757 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUMBP49757 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUMBP49757 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUMBP49757 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUMBP49757 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUMBP49757 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUMBP49757 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUMBP49757 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUMBP49757 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms