Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP4P49662 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP4P49662 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP4P49662 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP4P49662 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASP4P49662 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP4P49662 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP4P49662 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP4P49662 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP4P49662 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASP4P49662 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASP4P49662 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP4P49662 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP4P49662 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP4P49662 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASP4P49662 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP4P49662 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASP4P49662 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CASP4P49662 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP4P49662 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP4P49662 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASP4P49662 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP4P49662 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASP4P49662 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP4P49662 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP4P49662 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASP4P49662 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP4P49662 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP4P49662 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP4P49662 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASP4P49662 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP4P49662 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASP4P49662 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP4P49662 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP4P49662 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP4P49662 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP4P49662 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP4P49662 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP4P49662 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP4P49662 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP4P49662 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP4P49662 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP4P49662 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP4P49662 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP4P49662 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP4P49662 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP4P49662 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP4P49662 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP4P49662 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP4P49662 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP4P49662 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP4P49662 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP4P49662 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP4P49662 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP4P49662 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP4P49662 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP4P49662 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP4P49662 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP4P49662 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP4P49662 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP4P49662 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP4P49662 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP4P49662 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP4P49662 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CASP4P49662 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP4P49662 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP4P49662 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP4P49662 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP4P49662 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP4P49662 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms