Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HARS2P49590 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HARS2P49590 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARS2P49590 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HARS2P49590 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARS2P49590 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARS2P49590 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARS2P49590 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HARS2P49590 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARS2P49590 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARS2P49590 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HARS2P49590 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HARS2P49590 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HARS2P49590 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARS2P49590 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HARS2P49590 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARS2P49590 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARS2P49590 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HARS2P49590 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HARS2P49590 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARS2P49590 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HARS2P49590 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HARS2P49590 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HARS2P49590 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HARS2P49590 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HARS2P49590 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARS2P49590 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARS2P49590 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARS2P49590 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HARS2P49590 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARS2P49590 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARS2P49590 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARS2P49590 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HARS2P49590 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HARS2P49590 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARS2P49590 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARS2P49590 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARS2P49590 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARS2P49590 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HARS2P49590 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HARS2P49590 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HARS2P49590 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HARS2P49590 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HARS2P49590 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARS2P49590 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HARS2P49590 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARS2P49590 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARS2P49590 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARS2P49590 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARS2P49590 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARS2P49590 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARS2P49590 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARS2P49590 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARS2P49590 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HARS2P49590 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HARS2P49590 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARS2P49590 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARS2P49590 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARS2P49590 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARS2P49590 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARS2P49590 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARS2P49590 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARS2P49590 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARS2P49590 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARS2P49590 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms