Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMTP48728 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMTP48728 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMTP48728 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMTP48728 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AMTP48728 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
AMTP48728 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMTP48728 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMTP48728 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMTP48728 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AMTP48728 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMTP48728 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMTP48728 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMTP48728 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMTP48728 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMTP48728 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMTP48728 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMTP48728 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMTP48728 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMTP48728 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMTP48728 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMTP48728 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMTP48728 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMTP48728 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMTP48728 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMTP48728 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMTP48728 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMTP48728 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMTP48728 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMTP48728 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMTP48728 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMTP48728 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMTP48728 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMTP48728 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMTP48728 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMTP48728 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMTP48728 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMTP48728 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMTP48728 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMTP48728 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMTP48728 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
AMTP48728 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AMTP48728 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AMTP48728 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AMTP48728 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AMTP48728 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AMTP48728 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AMTP48728 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AMTP48728 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AMTP48728 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AMTP48728 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AMTP48728 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AMTP48728 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AMTP48728 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AMTP48728 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AMTP48728 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AMTP48728 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AMTP48728 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AMTP48728 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms