Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCP4P48539 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCP4P48539 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCP4P48539 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCP4P48539 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCP4P48539 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCP4P48539 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCP4P48539 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCP4P48539 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCP4P48539 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCP4P48539 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PCP4P48539 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCP4P48539 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCP4P48539 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCP4P48539 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCP4P48539 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCP4P48539 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCP4P48539 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCP4P48539 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCP4P48539 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCP4P48539 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCP4P48539 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCP4P48539 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCP4P48539 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCP4P48539 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCP4P48539 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCP4P48539 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCP4P48539 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCP4P48539 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCP4P48539 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCP4P48539 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCP4P48539 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCP4P48539 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCP4P48539 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCP4P48539 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCP4P48539 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCP4P48539 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCP4P48539 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCP4P48539 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCP4P48539 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCP4P48539 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCP4P48539 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCP4P48539 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCP4P48539 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCP4P48539 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCP4P48539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCP4P48539 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCP4P48539 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCP4P48539 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCP4P48539 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCP4P48539 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCP4P48539 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCP4P48539 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCP4P48539 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PCP4P48539 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCP4P48539 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms