Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRGP48443 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RXRGP48443 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RXRGP48443 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRGP48443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRGP48443 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRGP48443 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRGP48443 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RXRGP48443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRGP48443 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RXRGP48443 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RXRGP48443 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RXRGP48443 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRGP48443 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRGP48443 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRGP48443 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RXRGP48443 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRGP48443 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRGP48443 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRGP48443 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RXRGP48443 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRGP48443 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRGP48443 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRGP48443 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRGP48443 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRGP48443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRGP48443 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRGP48443 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRGP48443 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRGP48443 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRGP48443 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRGP48443 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRGP48443 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRGP48443 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRGP48443 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRGP48443 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRGP48443 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRGP48443 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRGP48443 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRGP48443 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRGP48443 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRGP48443 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRGP48443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRGP48443 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRGP48443 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRGP48443 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRGP48443 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRGP48443 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRGP48443 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RXRGP48443 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RXRGP48443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRGP48443 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RXRGP48443 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRGP48443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RXRGP48443 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RXRGP48443 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRGP48443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRGP48443 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRGP48443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRGP48443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RXRGP48443 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRGP48443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRGP48443 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRGP48443 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RXRGP48443 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRGP48443 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRGP48443 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRGP48443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RXRGP48443 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RXRGP48443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms