Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN1BP46527 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN1BP46527 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDKN1BP46527 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms