Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR4A2P43354 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR4A2P43354 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR4A2P43354 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A2P43354 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms