Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC1A4P43007 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC1A4P43007 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC1A4P43007 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC1A4P43007 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC1A4P43007 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC1A4P43007 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms