Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP12P39900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP12P39900 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMP12P39900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP12P39900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP12P39900 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP12P39900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP12P39900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP12P39900 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP12P39900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP12P39900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP12P39900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP12P39900 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP12P39900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP12P39900 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP12P39900 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP12P39900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP12P39900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP12P39900 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP12P39900 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP12P39900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP12P39900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP12P39900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP12P39900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP12P39900 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP12P39900 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP12P39900 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP12P39900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP12P39900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP12P39900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP12P39900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP12P39900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP12P39900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP12P39900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP12P39900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP12P39900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP12P39900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP12P39900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP12P39900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP12P39900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP12P39900 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP12P39900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP12P39900 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP12P39900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP12P39900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP12P39900 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP12P39900 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP12P39900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP12P39900 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP12P39900 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP12P39900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP12P39900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP12P39900 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP12P39900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP12P39900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP12P39900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP12P39900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms