Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGP37231 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGP37231 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARGP37231 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARGP37231 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPARGP37231 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARGP37231 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGP37231 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGP37231 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGP37231 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGP37231 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGP37231 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGP37231 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGP37231 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGP37231 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGP37231 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGP37231 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGP37231 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGP37231 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGP37231 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGP37231 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGP37231 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGP37231 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGP37231 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGP37231 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGP37231 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGP37231 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGP37231 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGP37231 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPARGP37231 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGP37231 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGP37231 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGP37231 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGP37231 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGP37231 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGP37231 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGP37231 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGP37231 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGP37231 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGP37231 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGP37231 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGP37231 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGP37231 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGP37231 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGP37231 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPARGP37231 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGP37231 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGP37231 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGP37231 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPARGP37231 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPARGP37231 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGP37231 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPARGP37231 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPARGP37231 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGP37231 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGP37231 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGP37231 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGP37231 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPARGP37231 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPARGP37231 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPARGP37231 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGP37231 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGP37231 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGP37231 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPARGP37231 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPARGP37231 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGP37231 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGP37231 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGP37231 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGP37231 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPARGP37231 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms