Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH11P35749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH11P35749 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH11P35749 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH11P35749 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH11P35749 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH11P35749 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH11P35749 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH11P35749 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH11P35749 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH11P35749 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH11P35749 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH11P35749 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH11P35749 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH11P35749 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH11P35749 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH11P35749 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH11P35749 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH11P35749 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH11P35749 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH11P35749 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH11P35749 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH11P35749 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH11P35749 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH11P35749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH11P35749 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH11P35749 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH11P35749 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH11P35749 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH11P35749 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH11P35749 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH11P35749 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH11P35749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH11P35749 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH11P35749 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH11P35749 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYH11P35749 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH11P35749 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYH11P35749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MYH11P35749 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYH11P35749 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYH11P35749 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH11P35749 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH11P35749 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH11P35749 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH11P35749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYH11P35749 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH11P35749 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH11P35749 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYH11P35749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH11P35749 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH11P35749 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH11P35749 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH11P35749 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYH11P35749 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYH11P35749 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYH11P35749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MYH11P35749 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYH11P35749 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYH11P35749 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYH11P35749 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYH11P35749 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYH11P35749 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYH11P35749 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MYH11P35749 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYH11P35749 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYH11P35749 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MYH11P35749 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms