Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP7BP35670 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7BP35670 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATP7BP35670 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7BP35670 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7BP35670 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7BP35670 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms