Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP214P35658 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP214P35658 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP214P35658 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP214P35658 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP214P35658 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP214P35658 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP214P35658 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP214P35658 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP214P35658 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP214P35658 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP214P35658 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP214P35658 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP214P35658 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP214P35658 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NUP214P35658 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP214P35658 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP214P35658 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP214P35658 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP214P35658 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP214P35658 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP214P35658 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP214P35658 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP214P35658 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP214P35658 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP214P35658 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP214P35658 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP214P35658 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP214P35658 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP214P35658 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP214P35658 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP214P35658 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP214P35658 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP214P35658 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP214P35658 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP214P35658 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP214P35658 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP214P35658 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP214P35658 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP214P35658 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP214P35658 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP214P35658 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP214P35658 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP214P35658 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP214P35658 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP214P35658 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP214P35658 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP214P35658 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP214P35658 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP214P35658 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP214P35658 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP214P35658 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP214P35658 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP214P35658 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP214P35658 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP214P35658 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP214P35658 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP214P35658 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP214P35658 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP214P35658 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP214P35658 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP214P35658 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP214P35658 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP214P35658 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP214P35658 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP214P35658 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms