Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJA4P35212 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA4P35212 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA4P35212 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA4P35212 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA4P35212 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJA4P35212 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJA4P35212 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA4P35212 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GJA4P35212 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GJA4P35212 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA4P35212 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA4P35212 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA4P35212 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA4P35212 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GJA4P35212 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA4P35212 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA4P35212 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA4P35212 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJA4P35212 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA4P35212 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA4P35212 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJA4P35212 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA4P35212 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJA4P35212 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA4P35212 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA4P35212 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA4P35212 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA4P35212 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJA4P35212 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA4P35212 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA4P35212 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA4P35212 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA4P35212 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA4P35212 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA4P35212 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA4P35212 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA4P35212 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA4P35212 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA4P35212 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA4P35212 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA4P35212 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA4P35212 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA4P35212 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA4P35212 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA4P35212 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA4P35212 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA4P35212 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA4P35212 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA4P35212 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA4P35212 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA4P35212 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA4P35212 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA4P35212 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA4P35212 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJA4P35212 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA4P35212 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA4P35212 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA4P35212 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA4P35212 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA4P35212 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA4P35212 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA4P35212 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA4P35212 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA4P35212 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA4P35212 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJA4P35212 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA4P35212 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA4P35212 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA4P35212 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA4P35212 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA4P35212 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA4P35212 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA4P35212 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA4P35212 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA4P35212 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA4P35212 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms