Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTX2P32243 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTX2P32243 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTX2P32243 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTX2P32243 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTX2P32243 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTX2P32243 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTX2P32243 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTX2P32243 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTX2P32243 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTX2P32243 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTX2P32243 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTX2P32243 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTX2P32243 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTX2P32243 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTX2P32243 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTX2P32243 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTX2P32243 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTX2P32243 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTX2P32243 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTX2P32243 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTX2P32243 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTX2P32243 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTX2P32243 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTX2P32243 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTX2P32243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTX2P32243 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTX2P32243 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTX2P32243 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTX2P32243 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTX2P32243 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTX2P32243 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTX2P32243 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTX2P32243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTX2P32243 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTX2P32243 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTX2P32243 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTX2P32243 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTX2P32243 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTX2P32243 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTX2P32243 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTX2P32243 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTX2P32243 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTX2P32243 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTX2P32243 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTX2P32243 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX2P32243 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX2P32243 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX2P32243 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX2P32243 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTX2P32243 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTX2P32243 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTX2P32243 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTX2P32243 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTX2P32243 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTX2P32243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTX2P32243 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTX2P32243 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTX2P32243 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTX2P32243 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTX2P32243 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTX2P32243 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTX2P32243 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTX2P32243 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTX2P32243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTX2P32243 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTX2P32243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTX2P32243 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.2 ms