Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBL1P28749 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBL1P28749 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBL1P28749 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBL1P28749 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBL1P28749 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RBL1P28749 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBL1P28749 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBL1P28749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBL1P28749 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBL1P28749 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBL1P28749 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBL1P28749 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBL1P28749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBL1P28749 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBL1P28749 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBL1P28749 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBL1P28749 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBL1P28749 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBL1P28749 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RBL1P28749 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBL1P28749 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBL1P28749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBL1P28749 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RBL1P28749 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBL1P28749 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBL1P28749 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBL1P28749 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBL1P28749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBL1P28749 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBL1P28749 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBL1P28749 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBL1P28749 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBL1P28749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBL1P28749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBL1P28749 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBL1P28749 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBL1P28749 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBL1P28749 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBL1P28749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBL1P28749 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBL1P28749 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBL1P28749 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBL1P28749 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBL1P28749 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBL1P28749 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBL1P28749 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBL1P28749 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBL1P28749 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBL1P28749 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBL1P28749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBL1P28749 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBL1P28749 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBL1P28749 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBL1P28749 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBL1P28749 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBL1P28749 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBL1P28749 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBL1P28749 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBL1P28749 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBL1P28749 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBL1P28749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBL1P28749 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBL1P28749 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBL1P28749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBL1P28749 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBL1P28749 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBL1P28749 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBL1P28749 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBL1P28749 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms