Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD3P28288 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD3P28288 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD3P28288 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD3P28288 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD3P28288 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD3P28288 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms