Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSSP25774 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSSP25774 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSSP25774 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSSP25774 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSSP25774 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSSP25774 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSSP25774 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSSP25774 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSSP25774 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSSP25774 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSSP25774 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSSP25774 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSSP25774 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSSP25774 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSSP25774 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSSP25774 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSSP25774 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSSP25774 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSSP25774 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSSP25774 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSSP25774 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSSP25774 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSSP25774 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSSP25774 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSSP25774 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSSP25774 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSSP25774 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSSP25774 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSSP25774 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSSP25774 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSSP25774 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSSP25774 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSSP25774 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSSP25774 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSSP25774 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSSP25774 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSSP25774 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSSP25774 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSSP25774 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSSP25774 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSSP25774 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSSP25774 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSSP25774 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSSP25774 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSSP25774 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSSP25774 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSSP25774 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSSP25774 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSSP25774 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSSP25774 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSSP25774 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSSP25774 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSSP25774 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSSP25774 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSSP25774 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSSP25774 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSSP25774 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSSP25774 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSSP25774 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSSP25774 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSSP25774 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSSP25774 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSSP25774 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSSP25774 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSSP25774 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSSP25774 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSSP25774 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms