Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTAFRP25105 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTAFRP25105 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTAFRP25105 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms