Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRM1P23921 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRM1P23921 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRM1P23921 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRM1P23921 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRM1P23921 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRM1P23921 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRM1P23921 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRM1P23921 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRM1P23921 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRM1P23921 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRM1P23921 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRM1P23921 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRM1P23921 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RRM1P23921 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRM1P23921 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRM1P23921 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRM1P23921 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRM1P23921 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRM1P23921 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRM1P23921 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRM1P23921 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRM1P23921 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRM1P23921 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRM1P23921 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RRM1P23921 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRM1P23921 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRM1P23921 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRM1P23921 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RRM1P23921 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRM1P23921 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRM1P23921 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRM1P23921 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRM1P23921 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRM1P23921 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRM1P23921 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRM1P23921 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRM1P23921 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRM1P23921 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRM1P23921 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRM1P23921 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRM1P23921 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRM1P23921 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RRM1P23921 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRM1P23921 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRM1P23921 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRM1P23921 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRM1P23921 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRM1P23921 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRM1P23921 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRM1P23921 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRM1P23921 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRM1P23921 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRM1P23921 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRM1P23921 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRM1P23921 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRM1P23921 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRM1P23921 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRM1P23921 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRM1P23921 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRM1P23921 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRM1P23921 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRM1P23921 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRM1P23921 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms