Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EIF4BP23588 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EIF4BP23588 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EIF4BP23588 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms