Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP100P23497 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP100P23497 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP100P23497 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP100P23497 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP100P23497 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP100P23497 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP100P23497 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP100P23497 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP100P23497 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP100P23497 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SP100P23497 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP100P23497 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP100P23497 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP100P23497 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP100P23497 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP100P23497 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SP100P23497 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP100P23497 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP100P23497 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP100P23497 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP100P23497 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP100P23497 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SP100P23497 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SP100P23497 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP100P23497 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SP100P23497 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SP100P23497 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP100P23497 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP100P23497 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SP100P23497 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP100P23497 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP100P23497 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP100P23497 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP100P23497 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP100P23497 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP100P23497 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SP100P23497 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP100P23497 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SP100P23497 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SP100P23497 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP100P23497 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP100P23497 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP100P23497 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP100P23497 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP100P23497 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP100P23497 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP100P23497 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP100P23497 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP100P23497 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP100P23497 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP100P23497 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SP100P23497 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP100P23497 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP100P23497 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP100P23497 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP100P23497 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP100P23497 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP100P23497 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP100P23497 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP100P23497 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP100P23497 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP100P23497 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SP100P23497 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP100P23497 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP100P23497 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SP100P23497 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP100P23497 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP100P23497 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP100P23497 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP100P23497 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SP100P23497 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP100P23497 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP100P23497 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SP100P23497 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP100P23497 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SP100P23497 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP100P23497 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SP100P23497 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SP100P23497 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SP100P23497 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SP100P23497 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms