Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1P23443 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPS6KB1P23443 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPS6KB1P23443 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPS6KB1P23443 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1P23443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPS6KB1P23443 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms