Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP8P22894 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP8P22894 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP8P22894 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP8P22894 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP8P22894 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP8P22894 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP8P22894 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP8P22894 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP8P22894 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP8P22894 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP8P22894 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP8P22894 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP8P22894 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP8P22894 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP8P22894 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP8P22894 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP8P22894 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP8P22894 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP8P22894 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP8P22894 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP8P22894 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP8P22894 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP8P22894 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP8P22894 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP8P22894 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP8P22894 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP8P22894 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP8P22894 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP8P22894 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP8P22894 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP8P22894 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP8P22894 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP8P22894 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP8P22894 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP8P22894 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP8P22894 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP8P22894 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP8P22894 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP8P22894 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP8P22894 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP8P22894 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP8P22894 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP8P22894 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP8P22894 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP8P22894 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP8P22894 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP8P22894 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP8P22894 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP8P22894 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP8P22894 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP8P22894 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP8P22894 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP8P22894 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP8P22894 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP8P22894 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP8P22894 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP8P22894 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP8P22894 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP8P22894 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP8P22894 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP8P22894 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP8P22894 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP8P22894 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP8P22894 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP8P22894 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP8P22894 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP8P22894 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP8P22894 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP8P22894 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MMP8P22894 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP8P22894 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP8P22894 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP8P22894 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP8P22894 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms