Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKACGP22612 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKACGP22612 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKACGP22612 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKACGP22612 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKACGP22612 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms