Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSR1P21757 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSR1P21757 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSR1P21757 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSR1P21757 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSR1P21757 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSR1P21757 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSR1P21757 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSR1P21757 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSR1P21757 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSR1P21757 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSR1P21757 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSR1P21757 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSR1P21757 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSR1P21757 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSR1P21757 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSR1P21757 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSR1P21757 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSR1P21757 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSR1P21757 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSR1P21757 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSR1P21757 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSR1P21757 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSR1P21757 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSR1P21757 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSR1P21757 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSR1P21757 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSR1P21757 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSR1P21757 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSR1P21757 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSR1P21757 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSR1P21757 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSR1P21757 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSR1P21757 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSR1P21757 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSR1P21757 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSR1P21757 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSR1P21757 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSR1P21757 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSR1P21757 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSR1P21757 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSR1P21757 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSR1P21757 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSR1P21757 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSR1P21757 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSR1P21757 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSR1P21757 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSR1P21757 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MSR1P21757 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSR1P21757 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSR1P21757 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSR1P21757 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSR1P21757 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSR1P21757 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSR1P21757 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSR1P21757 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSR1P21757 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSR1P21757 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSR1P21757 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSR1P21757 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSR1P21757 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSR1P21757 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSR1P21757 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSR1P21757 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSR1P21757 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSR1P21757 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSR1P21757 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms