Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA5P20719 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA5P20719 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA5P20719 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms